Prêmios da Fundação de Acidemia Propiônica $50,000 Concessão de Continuação para Guo-Fang Zhang na Duke University

Prêmios da Fundação de Acidemia Propiônica $50,000 Concessão de Continuação

Propionil-CoA e propionilcarnitina mediam complicações cardíacas em pacientes com acidemia propiônica
Guo-Fang Zhang, PhD
Duke University, Durham NC, USA
Termo de concessão: 4/1/2023-3/31/2024
A doença cardíaca tem alta prevalência entre os pacientes com acidemia propiônica (PA). O mecanismo patológico permanece amplamente desconhecido, particularmente devido à natureza do desenvolvimento crônico. É um desafio prever o desenvolvimento de doenças cardíacas em pacientes com PA simplesmente pelas mutações do PCC, propionyl-CoA carboxylase (PCC) atividade enzimática ou alterações metabólicas agudas no plasma ou na urina porque não há forte correlação entre o fenótipo cardíaco (gravidade da doença) e genótipo, descompensações metabólicas ou atividade enzimática residual foram observadas nos casos clínicos.
Ácidos graxos com vários comprimentos de cadeia são os principais combustíveis para o coração. Nossos dados anteriores demonstraram que o propionato, em vez dos aminoácidos, é a principal fonte de propionil-CoA cardíaco. In addition, a deficiência de PCC reduz a eliminação hepática de propionato derivado do microbioma e promove a síntese de ácidos graxos de cadeia ímpar, ambos impõem estresse metabólico ao coração. O acúmulo de propionil-CoA derivado do propionato e ácidos graxos de cadeia ímpar pode interromper o metabolismo energético cardíaco. O menor
ATP inibe ainda mais a carboxilação de propionil-CoA, de acordo com nosso recente estudo de isquemia. O metabolismo energético prejudicado e o acúmulo de propionil-CoA formam um círculo vicioso.
Com um subsídio de terceiro ano do PAF, vamos colaborar com os Drs. Eva Richard Rodríguez e Lourdes R. Desviat da Universidade Autónoma de Madrid sobre como o metabolismo energético na PCCA- or PCCB- iPSC-cardiomiócitos derivados de pacientes humanos são alterados por análise de isótopos estáveis, particularmente sob o estresse de propionato e ácidos graxos de cadeia ímpar. Outro objetivo é melhorar o metabolismo da energia cardíaca, visando o metabolismo do propionato e dos ácidos graxos de cadeia ímpar.

PAF concede bolsa de pesquisa inicial Houten DeVita

PAF Awards $50,000 Nova Bolsa de Pesquisa

 

PI: Sander Houten, Ph.D., Departamento de Genética e Ciências Genômicas,

Instituto Icahn para Ciência de Dados e Tecnologia Genômica, Escola de Medicina Icahn no Monte Sinai, Nova Iorque, US

 

 

 

Co-PI: Robert J. DeVita, Ph.D., Departamento de Ciências Farmacológicas, Drug Discovery Institute,

Escola de Medicina Icahn no Monte Sinai, Nova Iorque, US

 

 

“Redução de substrato como uma nova estratégia terapêutica para acidemia propiônica ”

O metabolismo dos aminoácidos e, em particular, a degradação da valina e isoleucina são uma fonte significativa de propionil-CoA, o substrato de propionil-CoA carboxilase. O tratamento atual da acidemia propiônica visa diminuir a degradação da valina e isoleucina por meio de dietas médicas e evitar o jejum. Drs. Houten e DeVita, os investigadores neste projeto, objetivam desenvolver uma terapia de redução de substrato farmacológico para acidemia propiônica que limite a degradação desses aminoácidos. Eles propõem inibir a acil-CoA desidrogenase de cadeia curta / ramificada (SBCAD) e isobutiril-CoA desidrogenase (ACAD8), que estão envolvidos na degradação de isoleucina e valina, respectivamente. A inibição dessas enzimas é considerada segura porque, em contraste com a acidemia propiônica, defeitos herdados de SBCAD e ACAD8 são considerados condições benignas. Em modelos de linha celular, a inibição de SBCAD usando um KO genético ou um inibidor foi eficaz e levou a uma diminuição pronunciada no substrato de propionil-CoA carboxilase. Os pesquisadores esperam encontrar alguns inibidores de sucesso de SBCAD e ACAD8 que podem ser otimizados e servir como um ponto de partida para um programa de descoberta de drogas translacional mais amplo para o tratamento de acidemia propiônica.

Atualização do progresso de abril 2022

Em Janeiro de 2021, ficamos gratos por receber uma bolsa de pesquisa do PAF, que nos permitiu iniciar o desenvolvimento da redução do substrato farmacológico como uma nova abordagem terapêutica para a acidemia propiônica. Para este projeto, hipotetizamos que podemos alcançar uma redução clinicamente relevante no acúmulo de substratos propionil-CoA carboxilase pela inibição de enzimas que desempenham um papel na degradação de aminoácidos de cadeia ramificada. Especificamente, propomos inibir a acil-CoA desidrogenase de cadeia curta/ramificada (SBCAD) e isobutiril-CoA desidrogenase (ACAD8), que estão envolvidos na degradação de isoleucina e valina, respectivamente. Prevê-se que a inibição dessas enzimas seja segura porque os defeitos herdados de SBCAD e ACAD8 são considerados condições benignas. Em modelos de linha celular, a inibição do SBCAD usando um KO genético ou um inibidor foi eficaz, levando a uma diminuição pronunciada nos metabólitos derivados de propionil-CoA. A inibição de ACAD8 foi menos eficaz, o que pode ser explicado pela sobreposição na especificidade do substrato entre diferentes acil-CoA desidrogenases. O objetivo deste projeto é identificar pequenos inibidores de moléculas de SBCAD e ACAD8 que possam ser validados para servir como pontos de partida para um programa translacional mais amplo de descoberta de drogas para o tratamento da acidemia propiônica. Para atingir este objetivo, usamos a bolsa de pesquisa do PAF para desenvolver o em vitro ensaios bioquímicos e celulares úteis para triagem de matéria química para estabelecer se uma pequena molécula tem possibilidade de ser um inibidor eficaz de SBCAD ou ACAD8. Também realizamos uma triagem virtual para gerar uma lista de moléculas inibidoras candidatas para SBCAD e ACAD8. Destes potenciais inibidores de SBCAD, 91 foram adquiridos e testados no ensaio SBCAD. Unfortunately, nenhum dos compostos foi capaz de inibir SBCAD com alta afinidade provavelmente como resultado de limitações na modelagem computacional da estrutura da enzima. Este resultado indica que uma triagem maior e imparcial de alto rendimento é necessária para identificar inibidores de pequenas moléculas para SBCAD. Nosso ensaio enzimático parece bem adequado para essa abordagem e essa abordagem foi aplicada com sucesso a dois outros alvos enzimáticos sob investigação pela equipe (DHTKD1 [1] e domínio LOR de AASS (inédito)).

O progresso feito com os fundos do PAF nos permitiu propor este projeto de pesquisa para o NIH Small Grant Program (R03) do Instituto Nacional de Saúde Infantil e Desenvolvimento Humano Eunice Kennedy Shriver (NICHD). Esta bolsa foi concedida em setembro 2021, que nos permitiu continuar este trabalho para os próximos 2 years. Em colaboração com os Drs.. Vockley e Mohsen (Universidade de Pittsburgh), também solicitamos uma bolsa de projeto de pesquisa do NIH (R01; O potencial terapêutico de inibição de acil-CoA desidrogenases envolvidas na degradação de valina e isoleucina). Esta proposta está atualmente em análise.

PAF Awards $49,953 Nova Bolsa de Pesquisa – Natal

PAF Awards $49,953 Nova Bolsa de Pesquisa em 2021

PI: Pawel Swietach, Professor de fisiologia, Departamento de Fisiologia, Anatomia & Genetics, Universidade de Oxford, Inglaterra

“Propionilação de proteína aberrante e marcas distintas de histonas na acidemia propiônica: novos mecanismos de doença e fatores de risco para doença cardíaca ”

O desafio colocado em nossos corações – contrair e relaxar em uma sequência correta e com força adequada – é formidável. A solução biológica elegante para este problema mecânico é um órgão que bombeia milhões de litros de sangue para sustentar a vida por muitas décadas. Contudo, a qualidade e a duração da vida de uma pessoa estão fortemente ligadas à saúde cardíaca. Graças aos avanços científicos, melhores tratamentos estão agora disponíveis para doenças cardíacas, permitindo que os pacientes vivam mais e mais felizes. Nosso objetivo no British Heart Foundation Center of Research Excellence da Universidade de Oxford é garantir que o progresso científico aborde um amplo espectro de distúrbios, independentemente de sua incidência.

Problemas cardíacos são comuns na acidemia propiônica (PA). Infelizmente, cardiomiopatia dilatada e síndrome do QT longo são frequentemente a causa de morte na infância. Para tratar e prevenir estes problemas cardíacos, devemos primeiro entender os mecanismos subjacentes. Uma vez que esses processos são descritos, nosso objetivo é identificar alvos para drogas ou intervenções. Acreditamos que essa ambição é alcançável graças à riqueza de conhecimentos sobre o coração e ao vasto repertório de medicamentos aprovados para terapia em diversas outras doenças cardíacas. Muitos desses medicamentos podem ser “reaproveitados” para distúrbios associados à AF, dando esperança a muitas famílias para um tratamento oportuno.

Para este projeto financiado pelo PAF, reunimos um consórcio de cientistas que estão ansiosos para dedicar seus conhecimentos ao estudo de CF. A experiência do meu laboratório é em fisiologia celular cardíaca no contexto de distúrbios ácido-base. Temos a companhia de Tom Milne, professor associado de epigenética em Oxford, Holger Kramer, um especialista em proteômica, e Steve Krywawych, bioquímico principal do Great Ormond Street Hospital em Londres. Os recursos e instalações disponibilizados para este projeto incluem um modelo de mouse de PA, cortesia de Michael Barry e Lourdes Desviat, métodos para caracterizar a função cardíaca a partir da célula ao nível do órgão, bem como medições de alterações no nível de proteína e gene. Esta abordagem interdisciplinar, mas focada, nos permite identificar potenciais alvos para o tratamento da AP. Indeed, nossas descobertas preliminares apontam para uma dessas enzimas, e o objetivo deste projeto é testar e validar nossa hipótese.

PA está associado a grandes mudanças metabólicas, e muitas dessas substâncias não são meramente intermediárias em uma cadeia de eventos, mas pode ter fortes ações biológicas que nem sempre são intuitivas para prever. Nosso projeto investigará como o acúmulo de propionato afeta os genes cardíacos por meio de uma reação química que causa andaimes de DNA (chamadas histonas) para “abrir” genes que normalmente não deveriam ser expressos em um coração saudável. Muitos genes serão afetados por este, mas alguns estão mais intimamente ligados ao distúrbio cardíaco. Depois de identificar esses genes principais, vamos testar até que ponto o bloqueio deles pode ser curativo. Em paralelo, vamos investigar se o propionato também pode reagir com outros alvos na célula, como proteínas que sustentam a contração. Indeed, nosso trabalho sugere que um caminho promissor para a pesquisa está relacionado ao chamado acoplamento excitação-contração, um processo que converte eletricidade cardíaca em uma resposta mecânica.

Estamos entusiasmados por fazer parte da família de pesquisa PA e desejamos aproveitar esta oportunidade para convidar os pacientes, carreiras, e apoiadores ao nosso laboratório para uma visita.


Atualizar 8/2022 – Relatório final

PROPIONILAÇÃO DE PROTEÍNA ABERRANTE E MARCAS DE HISTONAS DISTINTAS NA ACIDEMIA PROPIÔNICA: NOVOS MECANISMOS DE DOENÇA E FATORES DE RISCO PARA

DOENÇA CARDÍACA
Relatório Final – Agosto 2022
PI: Pawel Swietach (Universidade de Oxford)

Relatório não confidencial para divulgação

Pacientes afetados por acidemia propiônica (PA) apresentar distúrbios nos níveis de metabólitos, notavelmente propionato. Este pequeno (três carbonos) molécula é normalmente produzida
da quebra de substâncias na dieta, como aminoácidos de cadeia ramificada e ácidos graxos ímpares. na PA, contudo, genes responsáveis ​​pelo processamento de propionato são
inativado por mutações herdadas. Uma visão de longa data postula que o meio bioquímico resultante é responsável pela disfunção de múltiplos órgãos afetados na AP.
Compreender como o coração é afetado na AP é particularmente importante, porque muitas mortes na infância foram associadas a doenças cardíacas. Contudo, o mecanismo preciso
vincular o distúrbio metabólico com doença cardíaca na AP não é clara. Sem esta informação detalhada, é difícil propor novas curas e melhorar o manejo da doença antes
terapias genéticas viáveis ​​estão disponíveis. Moreover, o conhecimento dos mecanismos moleculares tem um impacto mais amplo na saúde cardíaca, porque elevações de propionato também foram
descrito em outras doenças, como diabete.

O objetivo do nosso projeto PAF foi investigar como os distúrbios metabólicos no PA afetam as proteínas através das chamadas modificações pós-traducionais, i.e. "edição" química
que podem afetar suas funções. Usando um modelo de mouse de PA, mostramos que as histonas, o andaime de proteína do DNA, sofrer dois tipos de modificações no coração: propionilação e acetilação. Em seguida, demonstramos como essas ações afetam a expressão de genes no coração. Surpreendentemente, descobrimos que vários genes, previamente implicado em doenças cardíacas, tornar-se aberrantemente ativado em PA, e especulamos que atenuar essa resposta genética dirigida por PA pode aliviar as alterações patológicas experimentadas pelos pacientes. Através de nossas observações do modelo do mouse de PA, identificamos uma nova via bioquímica que oferece um meio alternativo de processar o excesso de propionato no coração. A ativação dessa via foi associada a uma apresentação menos grave da doença em camundongos. Nossa hipótese é que essa via poderia ser explorada terapeuticamente em pacientes com PA, e nossos objetivos imediatos para o futuro são identificar a melhor abordagem para explorar esse reservatório protetor de propionato no coração.

Resumindo, o projeto PAF tem (eu) forneceu novos insights mecanísticos sobre como o propionato afeta o coração usando métodos de ponta em metabolômica, transcriptômica,
biologia da cromatina, e fisiologia, e (ii) revelou novos caminhos para o processamento de propionato que contornam as enzimas mutantes em pacientes com PA.

 

PAF concede subvenção de continuação a Guofang Zhang na Duke University

Guofang Zhang, PhD, Duke University

“Propionil-CoA e propionilcarnitina mediar complicações cardíacas em pacientes com acidemia propiónico”

atualização de março 2023

A doença cardíaca tem alta prevalência entre os pacientes com acidemia propiônica (PA). O mecanismo patológico permanece amplamente desconhecido, particularmente devido à natureza do desenvolvimento crônico. É um desafio predizer o desenvolvimento de doenças cardíacas em pacientes com PA simplesmente pela PCC mutações, propionyl-CoA carboxylase (PCC) atividade enzimática ou alterações metabólicas agudas no plasma ou na urina porque não há forte correlação entre o fenótipo cardíaco (gravidade da doença) e genótipo, descompensações metabólicas ou atividade enzimática residual foram observadas nos casos clínicos.

Ácidos graxos com vários comprimentos de cadeia são os principais combustíveis para o coração. Nossos dados anteriores demonstraram que o propionato, em vez dos aminoácidos, é a principal fonte de propionil-CoA cardíaco. In addition, a deficiência de PCC reduz a eliminação hepática de propionato derivado do microbioma e promove a síntese de ácidos graxos de cadeia ímpar, ambos impõem estresse metabólico ao coração. O acúmulo de propionil-CoA derivado do propionato e ácidos graxos de cadeia ímpar pode interromper o metabolismo energético cardíaco. O baixo ATP inibe ainda mais a carboxilação de propionil-CoA, de acordo com nosso recente estudo de isquemia. O metabolismo energético prejudicado e o acúmulo de propionil-CoA formam um círculo vicioso.

Com um subsídio de terceiro ano do PAF, vamos colaborar com os Drs. Eva Richard Rodríguez e Lourdes R. Desviat da Universidade Autónoma de Madrid sobre como o metabolismo energético na PCCA- or PCCB- iPSC-cardiomiócitos derivados de pacientes humanos são alterados por análise de isótopos estáveis, particularmente sob o estresse de propionato e ácidos graxos de cadeia ímpar. Outro objetivo é melhorar o metabolismo da energia cardíaca, visando o metabolismo do propionato e dos ácidos graxos de cadeia ímpar.

Atualizar agosto 2020

A doença cardíaca é uma das complicações frequentemente associadas à acidemia propiônica (PA). Compreender o mecanismo patológico é essencial para prevenir o desenvolvimento de complicações. Nossa pesquisa anterior mostrou que o acúmulo de propionil-CoA inibe o metabolismo de ácidos graxos, que é um importante combustível para a energia cardíaca. A perda da flexibilidade da troca de combustível pode interferir no metabolismo energético cardíaco e potencialmente desenvolver complicações cardíacas, particularmente sob vários estresses. Nossa pesquisa foi financiada pelo PAF para investigar o mecanismo patológico da cardiomiopatia associada à AP em 2019. No ano 1 do prêmio PAF, começamos a mapear a fonte metabólica de propionil-CoA no coração. Surpreendentemente, os aminoácidos (isoleucina, threonine, methionine, valina) e proteínas que são conhecidas como substratos de propionil-CoA têm contribuição insignificante para a produção de propionil-CoA no coração. Contudo, nossos dados não excluem a possibilidade de que esses aminoácidos contribuam substancialmente para a produção de propionil-CoA em outros órgãos, como fígado. O propionato circulante é uma fonte importante de propionil-CoA cardíaco. Também se encaixa na observação de que o coração prefere ácidos graxos, incluindo ácidos graxos de cadeia curta, como substratos energéticos.. Mais do que 99% propionato originário do microbioma é eficientemente removido/metabolizado em sua primeira passagem pelo fígado em roedores saudáveis. Therefore, propionato circulante mantém-se em nível muito baixo após o fígado. A deficiência de PCC atenua a capacidade hepática de eliminar propionato e aumenta o nível de propionato circulante, que exacerba o acúmulo de propionil-CoA no coração. Nossos resultados mostram o papel de “filtragem metabólica” do fígado na manutenção do metabolismo energético cardíaco eficiente.

Para entender o mecanismo patológico da complicação cardíaca associada à AP, um modelo de complicação cardíaca mediada por PA é essencial. No ano 2 do prêmio PAF, primeiro desenvolveremos e confirmaremos um modelo de camundongo com complicação cardíaca antes do estudo do mecanismo patológico. Com a colaboração do Dr.. Michael Barry, caracterizaremos a função cardíaca e o fenótipo metabólico da Pcca-/-(A138T) rato que é um modelo animal PA criado pelo Dr.. Michael Barry. Vamos induzir complicação cardíaca com Pcca-/-(A138T) camundongos por dietas ou estresses se for necessário. After that, examinaremos como o metabolismo energético cardíaco é perturbado usando fluxo metabólico baseado em isótopos estáveis ​​e abordagens RNA-Seq. Além disso, investigaremos ainda como a expansão da propionilcarnitina no coração poderia esgotar a acetilcarnitina cardíaca, tampão acetil-CoA, e afeta a demanda aguda de energia cardíaca. O objetivo de longo prazo de nossa pesquisa é encontrar um alvo terapêutico no metabolismo cardíaco de propionil-CoA para mitigar as complicações cardíacas associadas à AP.

PAF Grant Maclean

PAF Awards $50,000 Nova Bolsa de Pesquisa

Ken Maclean, PhD, Universidade do Colorado em Denver

“Tratamento químico da chaperona para restaurar a atividade enzimática nas mutações dobráveis ​​da propionil-Co-A carboxilase: Rumo a uma estratégia terapêutica personalizada na acidemia propiônica (PA)" - No verão 2020, PAF premiado com um $50,000 conceder.”

Acidemia propiônico (PA) é uma doença grave com risco de vida para a qual atualmente não existe tratamento verdadeiramente eficaz. A doença é causada por mutação em um dos dois genes que codificam a enzima propionil-CoA carboxilase (PCC). Esta enzima é composta de duas proteínas diferentes que se dobram em uma estrutura complexa com seis de cada uma dessas duas moléculas. Essa é uma estrutura muito incomum e complexa para uma enzima metabólica e trabalhos recentes em nosso laboratório descobriram que várias mutações específicas que causam PA causam problemas por interferir no processo de dobramento e / ou montagem de proteínas que leva a uma enzima não funcional e assim a doença. Nas células, proteínas com padrões complicados de dobragem são frequentemente auxiliadas na sua dobragem por outras proteínas chamadas chaperones. Observamos que várias formas mutantes de PCC podem ser restauradas à atividade normal se forem ajudadas a dobrar corretamente usando essas proteínas chaperonas. Em nosso estudo, examinaremos uma série de produtos químicos que também podem funcionar como acompanhantes e ajudar no dobramento de proteínas, com vistas a restaurar a atividade total em formas mutantes de PCC. Este trabalho ocorrerá inicialmente em um sistema de expressão bacteriana de PCC para identificar compostos promissores e, em seguida, dependendo do progresso, avançar para o tratamento de células derivadas de pacientes humanos com PCC. Esses estudos têm o potencial de servir como um primeiro passo inicial no desenho racional de uma estratégia de medicina personalizada para pacientes com mutações específicas que causam AF.

Resumo da pesquisa do PAF Elango

PAF Awards $44,253 Nova Bolsa de Pesquisa

Rajavel Elango, PhD, Universidade da Colúmbia Britânica

“Otimizando aminoácidos em alimentos médicos para gerenciar a acidemia propiônica ”

Acidemia propiônico (PA) é causada principalmente por um defeito enzimático, propionyl-CoA carboxylase (PCC), na via catabólica da valina, isoleucina e outros precursores propiogênicos. O manejo dietético da AF depende principalmente da restrição de proteínas dos alimentos para reduzir o suprimento de aminoácidos propiogênicos, e o uso de alimentos médicos especiais. Estes alimentos medicinais contêm todos os aminoácidos e nutrientes essenciais, mas nenhum composto propiogênico. Recentemente, preocupações foram levantadas sobre seu uso, devido ao conteúdo desequilibrado dos aminoácidos de cadeia ramificada (BCAA) – leucina alta, a mínima ou nenhuma valina e isoleucina. A mistura desequilibrada de BCAA afeta negativamente as concentrações plasmáticas de valina e isoleucina, e foi proposto para afetar o crescimento em pacientes pediátricos PA.

Em um estudo retrospectivo em andamento de história natural (n = 4), pacientes com AF tratados em nosso centro desde o nascimento (ou diagnóstico) envelhecer 18 anos, observamos que maior ingestão de alimentos medicinais (em comparação com a proteína intacta) resulta em menores escores Z de ht para idade. Com base nesses dados piloto, propomos que haja uma necessidade imediata de determinar a quantidade ideal de leucina para estar presente nos alimentos médicos.

Therefore, Os objetivos específicos do presente estudo são::

  1. Estudos de isótopos estáveis
    1. Determinar a proporção ideal entre BCAA em crianças usando o método estável de aminoácidos indicadores baseados em isótopos para otimizar a síntese de proteínas em uma abordagem de Prova de Princípio.
    2. Teste a proporção entre BCAA usando o mesmo método estável baseado em isótopos em nossa coorte de pacientes com AF para determinar o impacto na síntese de proteínas, e metabolito plasmático.
  2. Determinar o impacto do uso de recursos naturais (intacto) vs formula (comida medicinal) proteína em antropometria, resultados bioquímicos e clínicos por meio de um estudo retrospectivo de história natural de pacientes com AF atendidos no Hospital Infantil BC.

As recentes diretrizes alimentares para AF estão desencorajando a dependência de alimentos medicinais como única fonte alimentar. No entanto, a maioria dos indivíduos com AF está em risco de desnutrição e depende desses alimentos médicos como uma fonte facilmente tolerável de energia e proteína.. portanto, é necessário determinar a proporção ideal de BCAA em alimentos médicos para PA para otimizar a síntese de proteínas, promover anabolismo, crescimento e prevenir o acúmulo de metabólitos tóxicos.

Nosso laboratório, equipado com o uso de novos rastreadores isotópicos estáveis ​​para examinar o metabolismo de proteínas e aminoácidos, é ideal para abordar a questão da proporção ideal de BCAA a ser usada no manejo dietético da AF e impactar potencialmente os resultados de saúde.

 

Propiônico Acidemia Research Foundation Grant – Richard

PAF Awards $33,082.12 Bolsa de Pesquisa em 2019

PAF Awards $30,591 Subsídio de Continuação em 2020

Eva Richard, PhD, Universidad Autonoma de Madrid, Espanha

“Cardiomiócitos derivadas de células estaminais pluripotentes induzidas como um novo modelo para o desenvolvimento de terapia em acidemia propiónico”

A compreensão dos mecanismos celulares e moleculares que ocorrem em doenças genéticas é essencial para a investigação de novas estratégias para a sua prevenção e tratamento. Neste contexto, células estaminais pluripotentes induzidas (IPSC) oferecer oportunidades sem precedentes para modelar doenças humanas. Um dos poderes fundamentais da tecnologia iPSC reside na competência dessas células para ser direcionado para se tornar qualquer tipo de célula no corpo, permitindo assim que os investigadores para examinar os mecanismos da doença e identificar e testar novas terapias em tipos de células relevantes.

O principal objetivo deste projeto é focado na geração de cardiomiócitos iPSC derivados humanos (hiPSC-CMs) de acidemia propiónico (PA) pacientes como um novo modelo celular humano para o disease.In PA, sintomas cardíacos, nomeadamente a disfunção cardíaca e arritmias, foram reconhecidos como complicações tardias progressivas, resultando em uma das principais causas de mortalidade por doença. Usando hiPSC-CMs vamos estudar processos celulares, tais como a função mitocondrial e estresse oxidativo que foram reconhecidos como principais contribuintes para PA fisiopatologia. In addition, O nosso objectivo é o de revelar novos caminhos alterados usando técnicas de alto rendimento, tais como RNA-Seq e análise miARN. Também vamos examinar os potenciais efeitos benéficos de um antioxidante e um ativador de biogênese mitocondrial em cardiomiócitos PA. Os resultados que derivam deste projeto será relevante para a doença fornecendo informações sobre os processos biológicos afetados, e proporcionando, assim, ferramentas e modelos para a identificação de novos tratamentos adjuvantes para PA.

Atualização de abril 2020 – Eva Richard PhD

Graças à acidemia propiônica (PA) Fundação, desenvolvemos um novo modelo celular de PA baseado em células-tronco pluripotentes induzidas (IPSC) com o objetivo de definir novos patomecanismos de PA que poderiam ser potenciais alvos terapêuticos. Tradicionalmente, patofisiologia da doença tem sido estudados em linhas celulares imortalizadas ou humanos e em modelos animais. Unfortunately, células imortalizadas muitas vezes não respondem como células primárias e modelos animais não recapitulam exatamente os sintomas clínicos dos pacientes. So far, pacientes derivadas de fibroblastos têm sido utilizados principalmente como modelos celulares em PA, devido à sua disponibilidade e robustez, mas eles têm limitações importantes. A capacidade de reprogramar as células somáticas para iPSCs revolucionou o modo de modelar doenças humanas. Para estudar as doenças raras,
modelos de células-tronco portadores de mutações específicas do paciente tornaram-se altamente importante como todos os tipos de células podem ser diferenciadas das iPSCs.

Nós geramos e caracterizamos duas linhas iPSC de fibroblastos derivados de pacientes com defeitos nos genes PCCA e PCCB; e um controle isogênico no qual a mutação do paciente PCCB foi geneticamente corrigida usando a tecnologia CRISPR / Cas9. Essas linhas iPSC foram diferenciadas com sucesso em cardiomiócitos,
e sua presença foi facilmente estabelecida pela observação visual de regiões de contração espontânea e pela expressão de vários marcadores cardíacos. Cardiomiócitos derivados de PCCA iPSC exibiram consumo de oxigênio reduzido, um acúmulo de corpos residuais e gotículas de lipídios, e aumento da biogênese ribossomal. Além disso, encontramos níveis aumentados de proteína de HERP, GRP78, GRP75, SIG-1R e MFN2 sugerindo
estresse do retículo endoplasmático e perturbações do cálcio nessas células. Também analisamos uma série de miRNAs enriquecidos com coração previamente encontrados desregulados no tecido cardíaco de um modelo murino de PA e confirmamos sua expressão alterada.

O presente estudo representa o primeiro relato da caracterização de cardiomiócitos derivados de iPSCs gerados por pacientes com AP ́ reprogramação de fibroblastos. Nossos resultados fornecem evidências de que vários patomecanismos podem ter um papel relevante na disfunção cardíaca, uma complicação comum na doença de PA. Este novo modelo de PA celular oferece uma ferramenta poderosa para desvendar o mecanismo da doença e, potencialmente, para habilitar a droga
triagem / teste de drogas. Apesar da terapia melhorada nas últimas décadas, o resultado de pacientes com PA ainda é insatisfatório, destacando a necessidade de avaliar novas terapias destinadas a prevenir ou aliviar os sintomas clínicos. Pesquisas adicionais são necessárias para determinar a contribuição dos mecanismos identificados neste trabalho para o fenótipo cardíaco e como esse conhecimento pode ajudar a formular uma terapia mais personalizada
estratégias no futuro.

Agradecemos sinceramente à Fundação de Acidemia Propiônica por apoiar nossa investigação, o que resultou em uma experiência verdadeiramente motivadora para nós, sentindo que pertencemos à família de pesquisa PA. O financiamento que recebemos levou a avanços importantes na fisiopatologia de PA, e nosso objetivo é continuar esta pesquisa em um futuro próximo.

atualização de setembro 2019 – Eva Richard PhD

Existe uma necessidade clínica não satisfeita de desenvolver terapias eficazes para acidemia propiónico (PA). Avanços no tratamento de suporte com base na restrição dietética e suplementação carnitina permitiram os pacientes a viver para além do período neonatal. Contudo, o resultado global permanece fraca na maioria dos pacientes, que sofrem de inúmeras complicações relacionadas à progressão da doença, entre eles alterações cardíacas, uma das principais causas de morbidade e mortalidade PA. In our research, foi desenvolvido um novo modelo de celular da PA com base em células-tronco pluripotentes induzidas (IPSC) com o objectivo de definir novas vias moleculares envolvidos na fisiopatologia de PA que seria tratamento potencial direccionamento.

Tradicionalmente, patofisiologia da doença tem sido estudados em linhas celulares imortalizadas ou humanos e em modelos animais. Unfortunately, immortalizedcells muitas vezes não respondem como células primárias e modelos animais não exatamente recapitular os sintomas dos pacientes. So far, fibroblastos pacientes derivadas foram modelos celulares principalmente usedas em PAdue para theiravailability e robustez, mas eles têm limitações importantes.

A capacidade de reprogramar as células somáticas para iPSCs revolucionou o modo de modelar doenças humanas. Para estudar as doenças raras, modelos de células-tronco portadores de mutações específicas do paciente tornaram-se altamente importante como todos os tipos de células podem ser diferenciadas das iPSCs. Temos gerados e caracterizados duas linhas de IPSC a partir de fibroblastos de pacientes com defeitos derivadas em PCCA e PCCB genes. Estas linhas de IPSC podem ser diferenciadas em cardiomiócitos que imitam as características específicas para o tecido da doença. A presença de cardiomiócitos PA foi facilmente estabelecida por observação visual das regiões de contracção espontânea, e a expressão de vários marcadores cardíacos. Temos observado que os cardiomiócitos PCCA deficientes em apresentar um aumento nos produtos de degradação e em gotículas lipídicas, e exibem disfunção mitocondrial em comparação com células de controlo. Descobrimos ainda mais a infra-regulação de vários miRNAs em cardiomiócitos PCCA comparação para controlar os, e vários alvos miRNAs estão actualmente a ser analisados ​​a fim de investigar os mecanismos patológicos celulares subjacentes. Interestingly, temos realizado vários experimentos para analisar o efeito do ativador biogênese mitocondrial, composto MIN-102 (agonista de PPAR, derivado de pioglitazona) em cardiomiócitos.

Os resultados preliminares mostraram um aumento no consumo de oxigénio rateof células PCCA e controle. In our next steps, pretendemos completar a análise na linha de cardiomiócitos PCCA, caracterizar cardiomiócitos PCCB e para estudar a fundo o potencial terapêutico de MitoQ e MIN-102 compostos.

We would like to sincerely thank the Propionic Acidemia Foundation for supporting our research.

atualização de março 2020

“Cardiomiócitos derivados de células-tronco pluripotentes induzidas como um novo modelo para o desenvolvimento de terapia em acidemia propiônica.”

Eva Richard, Associate Professor

Existe uma necessidade clínica não satisfeita de desenvolver terapias eficazes para acidemia propiónico (PA). Avanços no tratamento de suporte com base na restrição dietética e suplementação carnitina permitiram os pacientes a viver para além do período neonatal. Contudo, o resultado global permanece fraca na maioria dos pacientes, que sofrem de inúmeras complicações relacionadas à progressão da doença, entre eles alterações cardíacas, uma das principais causas de morbidade e mortalidade PA. In our research, foi desenvolvido um novo modelo de celular da PA com base em células-tronco pluripotentes induzidas (IPSC) com o objetivo de definir novas vias moleculares envolvidos na fisiopatologia da PA que poderiam ser alvos potenciais terapêuticos.

Tradicionalmente, patofisiologia da doença tem sido estudados em linhas celulares imortalizadas ou humanos e em modelos animais. Unfortunately, células imortalizadas muitas vezes não respondem como células primárias e modelos animais não exatamente os sintomas dos pacientes recapitular. So far, pacientes derivadas de fibroblastos têm sido utilizados principalmente como modelos celulares em PA, devido à sua disponibilidade e robustez, mas eles têm limitações importantes.

A capacidade de reprogramar as células somáticas para iPSCs revolucionou o modo de modelar doenças humanas. Para estudar as doenças raras, modelos de células-tronco portadores de mutações específicas do paciente tornaram-se altamente importante como todos os tipos de células podem ser diferenciadas das iPSCs. Temos gerados e caracterizados duas linhas de IPSC de fibroblastos de pacientes com defeitos derivadas do PCCA e PCCB genes. Estas linhas de IPSC podem ser diferenciadas em cardiomiócitos que imitam as características específicas para o tecido da doença. A presença de cardiomiócitos foi facilmente estabelecido por observação visual das regiões contracção espontânea, e a expressão de vários marcadores cardíacos. cardiomiócitos PCCA iPSC derivados exibiram uma alteração do processo autofagia com uma acumulação de organismos residuais e disfunção mitocondrial caracterizados por consumo de oxigénio reduzido e alteração de biogénese mitocondrial devido a uma desregulação de PPARGC1A. Também foi avaliada a expressão de miARNs enriquecido de coração previamente associados com a disfunção cardíaca e vários miARNs foram encontrados desregulada. Além disso, encontramos aumento níveis de proteína de Herp, Grp78, Grp75, sigma-1R e MFN2 de stress e de cálcio perturbações sugerindo ER nestas células.

Estamos planejando para analisar cardiomiócitos PCCB para comparar os resultados com PCCA e dados de controle. Estamos trabalhando para obter os cardiomiócitos maduros, a fim de realizar estudos de eletrofisiologia (correntes de K +) usando um método de patch-clamp de cula completa. Estamos interessados ​​no estudo dos cardiomiócitos assinatura comparando bioenergéticos específicos de tecidos derivados de controlo e iPSCs PA patients' por microarrays proteicos de fase inversa (RPPMA). O trabalho futuro inclui também testar o efeito do ativador biogênese mitocondrial, composto MIN-102 (agonista de PPAR, derivado de pioglitazona) e do direccionamento mitocondrial antioxidante MitoQ em cardiomiócitos PA.

We would like to sincerely thank the Propionic Acidemia Foundation for supporting our research.

 

 

 

Propiônico Acidemia Research Foundation Grant Guofang Zhang

PAF Awards $48,500 Research Grant

Guofang Zhang, PhD, Duke University

“Propionil-CoA e propionilcarnitina mediar complicações cardíacas em pacientes com acidemia propiónico”

A produção de energia é o metabolismo cardíaco central para trabalho mecânico contínuo. Um coração humano adulto médio consome ~ 6 ATP kg / dia. armazenamento de ATP no coração é apenas suficiente para sustentar o batimento cardíaco durante alguns segundos. Um metabolismo energético cardíaco firmemente acoplada a partir de vários substratos é crítica para a produção de ATP suficiente exigida pela função normal do coração.

Uma molécula de ácido palmítico (ácido graxo) gera muito mais ATP do que uma molécula de glicose faz depois seus ácidos metabolism.Fatty completas contribuir ~ 70-90% da produção de energia cardíaca em condição normal. Contudo, coração ainda mantém uma elevada flexibilidade de troca de combustível em resposta a vários substratos disponíveis. Acetil-CoA é o primeiro metabolito convergente derivados dos diversos substratos de combustível através de vias diferentes e entra no ciclo do ácido tricarboxilico (TCAC) para produção de energia. Therefore, o nível de acetil-CoA ou a proporção de acetil-CoA / CoA firmemente controla os fluxos metabólicos de dois combustíveis principais, isto é, glucose e ácido gordo, no coração. nível CoA acetil-CoA ou também é afinado pelo acetiltransferase carnitina (CRATERA) que catalisa a interconversão reversível entre o nível de acil-CoA e acylcarnitines.Acetylcarnitine de cadeia curta é de ~ 10-100 vezes maior do que a de acetil-CoA no coração e é visto como o tampão de acetil-CoA. CRAT é altamente expresso em órgãos de alta energia exigentes, incluindo coração e medeia ácidos graxos e metabolismo da glicose, possivelmente, por interconversão de forma dinâmica acetil-CoA e acetilcarnitina em cada deficiência other.The de CRAT foi mostrado para alterar a seleção de combustível cardíaca.

Acidemia propiônico (PA) é frequentemente associada a complicações cardíacas. Contudo, o mecanismo patológico permanece desconhecido. Nós demonstramos que o propionato de alta exógeno conduziu à acumulação propionil-CoA e interruptor de combustível cardíaca a partir de ácido gordo de glicose nos corações de ratos normais perfundidos (Sou. J Physiol. Endocrinol. Metab., 2018.315:E622-E633). A deficiência da carboxilase de propionil-CoA em PA também induz a acumulação de propionil-CoA. Próximo, vamos tentar entender se e como a elevada propionil-CoA na PCCA-/- heart (colaboração com o Dr.. Michael Barry)poderia interromper o metabolismo energético cardíaco investigando a flexibilidade de troca de combustível, Crat metabolismo mediado, e capacidade tampão da acetilcarnitina usando análise de fluxo metabólico à base de isótopos estáveis (J. Biol. Chem., 2015,290:8121-32). Esperamos que o resultado deste projecto irá fornecer recomendação terapêutica significativa para os pacientes com PA, especialmente com a complicação cardíaca.

Novel therapies for Propionic acidemia – update Sept. 2018

Novel therapies for Propionic acidemia

Nicola Brunetti-Pierri, MD, Fondazione Telethon, Italy

This proposal was focused on the characterization of a fish model of propionic acidemia (PA) and on the development of novel therapies. The PA medaka fish model was found to recapitulate several clinical and biochemical features of the human disease, including reduced survival and locomotor activity, hepatic lipid accumulation, increased propionylcarnitine, methylcitrate, and propionate. Moreover, PA fishes showed better survival when fed with low-protein diet.

To gain insight into the disease pathogenesis and to search for potentially novel therapeutic targets, we performed an unbiased 3’-mRNA-Seq and NMR-based metabolome analyses. Both analyses showed global differences between PA and wild-type (wt) medaka. Interestingly, metabolism of glycine and serine resulted affected both at transcriptional and metabolites level and further studies are ongoing to investigate the role of these changes in the disease pathogenesis. Moreover, we found a marked increase in protein propionylation in PA fishes compared to wt controls. Protein propionylation is a post-translational modification occurring under normal conditions but its physiological role is unknown. Like protein acetylation, it is likely involved in regulation of gene expression, protein-protein interactions, and enzyme function. Interestingly, NAD-dependent sirtuins that are responsible of deacetylation of multiple proteins and have also de-propionylating activity, were significantly reduced in PA fishes. We speculated that aberrant protein propionylation in PA is toxic and proteomic studies are ongoing to reveal proteins with aberrant propionylation. With the support of this grant several drug candidates have been also investigated with the goal of developing new pharmacological approaches for PA.

In conclusion, we performed extensive phenotyping of the PA fish model that can be useful to unravel novel disease mechanisms and therapeutic targets.

setembro atualizada 2018

Segmentação Serina e tiol Metabolismo em Propionic Acidemia,,en,No projeto de pesquisa,,en,intitulado ",,en,Segmentação Serina e tiol Metabolismo em Propionic Acidemia”,,en,vamos definir o papel de novos caminhos de disfunção celular em Propionic Acidemia,,en,Foi conhecido há várias décadas que a causa genética de propiónico Acidemia é uma anormalidade em um dos genes que codificam para o propionil-CoA carboxilase,,en,levando à acumulação de ácido propiónico e é metabolitos,,en

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Hilary Vernon,,en,Instituto McKusick-Nathans da medicina genética,,en,John Hopkins University,,en,Maryland,,en,Hilary Vernon,,en,Instituto McKusick-Nathans da medicina genética,,en,John Hopkins University,,en,Maryland,,en,Hilary Vernon,,en,Instituto McKusick-Nathans da medicina genética,,en,John Hopkins University,,en,Maryland,,en,Hilary Vernon,,en,Instituto McKusick-Nathans da medicina genética,,en,John Hopkins University,,en,Maryland,,en,Hilary Vernon,,en,Instituto McKusick-Nathans da medicina genética,,en,John Hopkins University,,en,Maryland,,en, MD PhD, Johns Hopkins University

While it has been known for several decades that dysfunction of the enzyme propionyl-CoA carboxylase underlies propionic acidemia (PA), many key downstream metabolic adaptions to this primary defect are not well defined. In our research, we developed and studied a new cellular model of PA, with the goals of understanding how the cell is affected in PA, and to identify new pathways for potential treatment targeting.

We initially studied both protein expression in fibroblasts (skin cells) from individuals with PA, and metabolites in urine from individuals with PA, and discovered changes in pathways related to serine metabolism. Serine is an important amino acid that is involved in the synthesis of folate intermediates, glutathione, and other important cellular metabolites. Serine metabolism is of particular interest because it has also been shown recently to be dysregulated in other mitochondrial diseases, and there is a growing interest in how to target this pathway for therapeutic intervention.

In order to more closely study these findings, we developed a new cellular model of propionyl-CoA carboxylase deficiency, where we used CRISPR technology to mutate the PCCA gene in a kidney cell line called HEK293. This new model cell line has important biochemical hallmarks of PA, including absence of the PCCA protein, elevated propionyl-carnitine, very low methylmalonyl-carnitine, and elevated glycine. We discovered that when these cells are in the growth phase, they express genes involved in serine synthesis at higher levels than cells that have normal propionyl-CoA carboxylase activity. We further discovered that the PA cells are very sensitive to deprivation of serine in their culture media, and grow slower than cells with intact propionyl-CoA carboxylase activity. This growth abnormality is not seen when the cells are grown in media that contains serine. Interestingly, we looked at these same pathways in a CRISPR model of methylmalonic acidemia, a closely related disorder to PA, and while we found some overlap in sensitivity to serine, the gene expression patterns we different. This highlights the biochemical uniqueness of PA. Currently, we are completing flux metabolomics studies in these cells, which will determine exactly what this serine is being metabolized to, and we expect these experiments to be completed by the end of August. In our next steps, we plan to study how treating the cells with different metabolites may alleviate this serine growth defect.

We would like to sincerely thank the Propionic Acidemia Foundation for supporting our research. The funding we received has led to important breakthroughs in our work, and we are excited to continue to move this research forward in the coming years.

setembro atualizada 2018